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中央流行疫情指揮中心已將中國大陸流行地區判定，劃分為兩級：一級流行地區表示當地已出現明顯不易控制之社區傳播，目前湖北省已列為一級流行地區；二級流行地區表示懷疑當地已有社區傳播，有相關旅遊史應列入居家檢疫對象。並自2日起將廣東省列為二級流行地區，居住地在廣東之陸人則禁止入境；另小三通入境者，3日起一律居家檢疫14天。
衛生局表示，武漢肺炎感染源「2019-nCoV」為有套膜之RNA病毒，相關防疫措施類似流感等呼吸道傳染病，
1.預防傳染病首重手部衛生，應確實執行洗手5步驟
2.戶外或公共場所無洗手台，請使用酒精性乾洗手液至少3c.c.塗抹於雙手搓揉，而且切記不揉眼鼻口
3.使用口罩目的係阻隔飛沫與病菌，健康民眾僅出入醫院、密閉公共場所或大眾運輸工具等環境才建議配戴，如有生病者務必配戴
4.消毒是公共場所、居家環境阻斷病毒、細菌傳播最好的方法，75％的酒精對於有套膜冠狀病毒是有消毒效果
5.建請民眾請發揮公德心，生病請在家休息，請勿出入人口密集之公共場所或大眾運輸工具
因應武漢肺炎疫情，疾管署持續加強疫情監測與邊境管制措施，如有疑似症狀，請撥打：1922專線，或0800-001922，並依指示配戴口罩儘速就醫，同時主動告知醫師旅遊史及接觸史，以利及時診斷及通報。
